Mayo Clinic berharap untuk mengungkap bagaimana mikrobioma memengaruhi reaksi pasien terhadap obat kanker
Sebuah klinik terkemuka di AS berharap bank hayati limbah tinjanya akan membantu para peneliti membuat penemuan baru tentang cara merawat pasien kanker – salah satu dari beberapa upaya untuk mengubah limbah manusia menjadi obat.
Bank hayati Mayo Clinic merupakan bagian dari upaya para peneliti selama bertahun-tahun untuk “mempersonalisasi” pengobatan dengan mengungkap bagaimana mikrobioma mengubah reaksi pasien terhadap obat kanker.
“Jika saya dapat mengetahui dengan melihat mikrobioma dan gen seseorang tentang obat apa yang kemungkinan besar akan mereka tanggapi, saya ingin memilih obat itu sebagai langkah pertama,” kata Purna Kashyap, direktur program mikrobioma Mayo Clinic, yang mengawasi bank hayati tersebut.
Sebagai perbandingan, sebagian besar obat kanker saat ini digunakan sebagai rejimen atau, seperti yang dijelaskan Kashyap: “Semua orang mendapatkan ini sebagai terapi lini pertama, dan semua orang mendapatkan ini sebagai terapi lini kedua dan semua orang mendapatkan ini sebagai terapi lini ketiga.”
Inti dari upaya klinik untuk memahami mikrobioma adalah biobank yang berisi lebih dari 2.000 sampel tinja – koleksi dengan faktor ick – tetapi yang diharapkan para peneliti dapat membantu mereka memahami mengapa pasien merespons pengobatan kanker secara berbeda.
Ide di balik penelitian ini adalah, selain sel manusia, setiap orang memiliki mikrobioma, koleksi 100 juta “simbion mikroba”: bakteri. Mikrobioma adalah apa yang “kita andalkan untuk membantu nutrisi, melawan patogen, dan mendidik sistem kekebalan tubuh kita”, para peneliti pernah menulis untuk Science. Bakteri ini menjajah tubuh kita, dari kulit hingga usus.
Pekerjaan biobank pada kanker hanyalah salah satu dari beberapa upaya skala besar yang berupaya memahami bagaimana mikrobioma usus dapat memediasi bagaimana pasien merespons pengobatan kanker – seperti apakah tumor menyusut sebagai respons terhadap kemoterapi atau tingkat keparahan efek samping.
Sejalan dengan hal ini, para peneliti telah bereksperimen dengan menjajah usus pasien dengan bakteri baru melalui transplantasi tinja. Meskipun masih dalam tahap penelitian, uji coba telah menghasilkan beberapa hasil yang menjanjikan. Gagasan yang sama telah mendorong para peneliti untuk menyelidiki “crapsules” dan “crispr-ing” mikrobioma usus, menurut sebuah buku baru oleh Dr. Eric Topol, ketua departemen kedokteran translasional dari Scripps Research Institute.
Pekerjaan bank hayati swasta tersebut, dan harapan Kashyap bahwa bank tersebut dapat menerbitkan beberapa hasil pada musim panas ini, muncul ketika komunitas ilmiah yang lebih luas diserang oleh pemerintahan Trump. Gedung Putih telah mengusulkan pemotongan yang sangat besar pada lembaga-lembaga ilmiah AS, termasuk pemotongan sebesar 40% pada National Institutes of Health (NIH).
Sementara perusahaan-perusahaan swasta dan sistem-sistem rumah sakit, seperti Mayo Clinic, sedang mengerjakan studi-studi individual, hampir tidak ada seorang pun di komunitas penelitian yang percaya bahwa anggaran swasta yang “kecil” dapat mengisi kekosongan sebesar pemerintah federal.
Demikian pula, pemotongan sekitar 20.000 pekerjaan dari Departemen Kesehatan dan Layanan Kemanusiaan oleh menteri kesehatan Robert F Kennedy Jr telah membahayakan beberapa bank hayati pemerintah – seperti halnya bank Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit yang menyimpan sekitar 50.000 sampel gonore, yang nasibnya tidak diketahui setelah seluruh staf diberhentikan.
“Jenis-jenis perbankan hayati dan pengumpulan data yang didanai NIH bersifat terbuka dan tersedia secara terbuka,” kata Derek Lowe, seorang ahli kimia organik dan penulis blog In the Pipeline yang populer tentang pengembangan obat.
“Tidak banyak orang lain yang melakukan hal-hal seperti ini.”